Memorias de investigación
Ponencias en congresos:
Processing Pipeline for Digitalizing the Lineage Tree of Early Zebrafish Embryogenesis from Multiharmonic Imaging
Año:2011
Áreas de investigación
  • Equipo médico,
  • Tecnología electrónica y de las comunicaciones,
  • Industria electrónica
Datos
Descripción
The reconstruction of the cell lineage tree of early zebrafish embryogenesis requires the use of in-vivo microscopy imaging and image processing strategies. Second (SHG) and third harmonic generation (THG) microscopy observations in unstained zebrafish embryos allows to detect cell divisions and cell membranes from 1-cell to 1K-cell stage. In this article, we present an ad-hoc image processing pipeline for cell tracking and cell membranes segmentation enabling the reconstruction of the early zebrafish cell lineage tree until the 1K-cell stage. This methodology has been used to obtain digital zebrafish embryos allowing to generate a quantitative description of early zebrafish embryogenesis with minute temporal accuracy and ?m spatial resolution
Internacional
Si
Nombre congreso
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI 2011)
Tipo de participación
960
Lugar del congreso
Chicago, IL USA
Revisores
Si
ISBN o ISSN
1945-7936
DOI
10.1109/ISBI.2011.5872699
Fecha inicio congreso
30/03/2011
Fecha fin congreso
02/04/2011
Desde la página
1561
Hasta la página
1564
Título de las actas
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI 2011)
Esta actividad pertenece a memorias de investigación
Participantes
Grupos de investigación, Departamentos, Centros e Institutos de I+D+i relacionados
  • Creador: Grupo de Investigación: Tecnología de imágenes biomédicas
  • Centro o Instituto I+D+i: Centro de tecnología Biomédica CTB
  • Departamento: Ingeniería Electrónica