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Descripción
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| El trabajo ha consistido principalmente en el desarrollo de algoritmos de segmentación 3d+t de las imágenes del desarrollo embrionario del zebrafish (pez cebra) y el sea urchin (erizo de mar). Estas imágenes de microscopía confocal son obtenidas a partir de embriones mutantes que expresan su carácter fluorescente en núcleos y membranas. Durante la estancia se han integrado en la plataforma común los algoritmos de morfología matemática desarrollados previamente en Madrid. Así mismo se han desarrollado nuevos métodos de segmentación que permiten explotar la redundancia temporal de la información de núcleos y membranas. Así mismo con B.Lombardot y P. Bourgine se han iniciado las investigaciones para la definición dentro del contexto del proyecto del concepto ‘entropía morfogenética’ y definir de la misma manera medidas a diferentes escalas de correlaciones entre comportamientos celulares de organogénesis. La estrecha colaboración con el equipo de biólogos de Nadine Peyriéras ha permitido seguir una formación intensiva en aspectos de microscopía confocal (con acceso a dos de estos equipos), así como el aprendizaje de protocolos experimentales de biología y el estudio del desarrollo embrionario del Zebrafish y el Sea Urchin. También se ha trabajado en la acción integrada Morphonet, proponiendo redefinir el concepto de genetic network para pasar de una representación en diagrama de bloques a una representación que incluya sus aspectos morfodinámicos: dónde y cuándo se expresan los genes, con una definición a nivel celular. Para ello, se ha comenzado a desarrollar diversos algoritmos de tratamiento de imagen especialmente adaptados a este contexto. | |
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Internacional
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Si |
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Lugar
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Paris, Francia |
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Tipo
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Miembros en el extranjero |
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Fecha inicio
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09/04/2008 |
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Fecha fin
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16/07/2008 |