Observatorio de I+D+i UPM

Memorias de investigación
Otras publicaciones:
Multiscale area opening analysis for cell nuclei reconstruction with 4D structuring elements
Año:2010
Áreas de investigación
  • Tecnología electrónica y de las comunicaciones
Datos
Descripción
We present a filtering technique for extracting nuclei trajectories in 4D microscopy images of zebrafish embryogenesis based on a spatio-temporal granulometric analysis. Previous work showed that the morphological reconstruction operator with 4D structuring elements (SEs) allows us to directly recover nuclei trajectories as tubular-like structures in 4D. The performance and usability of this method is determined by two main factors. The first factor is the "intra-trajectory distance" -Dintra-, this means the maximum displacement of a nucleus between time frames, which is a function of the time step between image acquisitions, the spatial resolution and the cell speed. The other factor is the "inter-trajectory distance" -Dinter-, standing for the minimum distance between a nucleus and its neighbors in the spatio-temporal domain and is function of the microscopy resolution and the observed biological phenomena.
Internacional
Si
Entidad
Université René Descartes
Lugar
Paris
Páginas
49
Referencia/URL
2nd conference of the annual series ¿Morphogenesis in Living Systems¿
Tipo de publicación
Libro de resúmenes
Esta actividad pertenece a memorias de investigación
Participantes
  • Autor: David Pastor Escuredo (UPM)
  • Autor: Miguel Angel Luengo Oroz (UPM)
  • Autor: Andres de Santos Lleo (UPM)
Grupos de investigación, Departamentos, Centros e Institutos de I+D+i relacionados
  • Creador: Grupo de Investigación: Tecnología de imágenes biomédicas
  • Departamento: Ingeniería Electrónica
  • Centro o Instituto I+D+i: Centro de tecnología Biomédica CTB
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