Observatorio de I+D+i UPM

Memorias de investigación
Artículos en revistas:
An agent- and ontology-based system for integrating public gene, protein, and disease databases
Año:2007
Áreas de investigación
  • Inteligencia artificial
Datos
Descripción
In this paper, we describe OntoFusion, a database integration system. This system has been designed to provide unified access to multiple, heterogeneous biological and medical data sources that are publicly available over Internet. Many of these databases do not offer a direct connection, and inquiries must be made via Web forms, returning results as HTML pages. A special module in the OntoFusion system is needed to integrate these public 'Web-based' databases. Domain ontologies are used to do this and provide database mapping and unification. We have used the system to integrate seven significant and widely used public biomedical databases: OMIM, PubMed, Enzyme, Prosite and Prosite documentation, PDB, SNP, and InterPro. A case study is detailed in depth, showing system performance. We analyze the system's architecture and methods and discuss its use as a tool for biomedical researchers
Internacional
Si
JCR del ISI
Si
Título de la revista
J BIOMED INFORM
ISSN
1532-0464
Factor de impacto JCR
2
Información de impacto
Volumen
1
DOI
Número de revista
40
Desde la página
17
Hasta la página
29
Mes
FEBRERO
Ranking
Esta actividad pertenece a memorias de investigación
Participantes
  • Participante: F Martin-Sanchez
  • Participante: H Billhardt
  • Autor: Victor Manuel Maojo Garcia (UPM)
  • Participante: R Alonso-Calvo
  • Autor: Miguel Garcia Remesal (UPM)
Grupos de investigación, Departamentos, Centros e Institutos de I+D+i relacionados
  • Creador: Grupo de Investigación: Grupo de Informática Biomédica (LIA)
  • Departamento: Inteligencia Artificial
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