Observatorio de I+D+i UPM

Memorias de investigación
Artículos en revistas:
RDFBuilder: A tool to automatically build RDF-based interfaces for MAGE-OM microarray data sources
Año:2013
Áreas de investigación
  • Ciencias de la computación y tecnología informática
Datos
Descripción
This paper presents RDFBuilder, a tool that enables RDF-based access to MAGE-ML-compliant microarray databases. We have developed a system that automatically transforms the MAGE-OM model and microarray data stored in the ArrayExpress database into RDF format. Additionally, the system automatically enables a SPARQL endpoint. This allows users to execute SPARQL queries for retrieving microarray data, either from specific experiments or from more than one experiment at a time. Our system optimizes response times by caching and reusing information from previous queries. In this paper, we describe our methods for achieving this transformation. We show that our approach is complementary to other existing initiatives, such as Bio2RDF, for accessing and retrieving data from the ArrayExpress database.
Internacional
Si
JCR del ISI
Si
Título de la revista
COMPUTER METHODS AND PROGRAMS IN BIOMEDICINE
ISSN
0169-2607
Factor de impacto JCR
1,516
Información de impacto
Volumen
111
DOI
10.1016/j.cmpb.2013.04.009
Número de revista
1
Desde la página
220
Hasta la página
227
Mes
SIN MES
Ranking
0
Esta actividad pertenece a memorias de investigación
Participantes
  • Autor: Alberto Anguita Sanchez (UPM)
  • Autor: Luis Martín Martín
  • Autor: Miguel Garcia Remesal (UPM)
  • Autor: Victor Manuel Maojo Garcia (UPM)
Grupos de investigación, Departamentos, Centros e Institutos de I+D+i relacionados
  • Creador: Grupo de Investigación: Grupo de Informática Biomédica (GIB)
  • Departamento: Inteligencia Artificial
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