Observatorio de I+D+i UPM

Memorias de investigación
Capítulo de libro:
Pool-Seq analisys of mycrosymbiont selection by the legume plant host
Año:2015
Áreas de investigación
  • Genómica,
  • Bacteriología
Datos
Descripción
Next-generation sequencing of pooled DNA samples (Pool-Seq) is a cost-effective, attractive approach to study Rhizobium population genomics. We have established a data processing pipeline to align Pool-Seq datasets against a reference genome and to visualize and analyze read coverage and polymorphic sites (SNP) distribution in the population. This pipeline has been used to test the hypothesis ?and show at the genomic level? that different plant hosts (Pisum sativum and Vicia faba) of Rhizobium leguminosarum bv. viciae select specific genotypes from those present in a given soil. Advantages and limitations of the use of Pool-Seq for Rhizobium population genomic studies are also discussed.
Internacional
Si
DOI
10.1002/9781119053095.ch72
Edición del Libro
Editorial del Libro
John Wiley & Sons, Inc
ISBN
9781119053095
Serie
Título del Libro
Biological Nitrogen Fixation
Desde página
725
Hasta página
736
Esta actividad pertenece a memorias de investigación
Participantes
  • Autor: Beatriz Jorrin Rubio (UPM)
  • Autor: Juan Imperial Ródenas (UPM)
Grupos de investigación, Departamentos, Centros e Institutos de I+D+i relacionados
  • Creador: Grupo de Investigación: BIOLOGÍA MOLECULAR Y COMPUTACIONAL
  • Centro o Instituto I+D+i: Centro de Biotecnología y Genómica de Plantas, CBGP
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