Observatorio de I+D+i UPM

Memorias de investigación
Estancias o Sabáticos:
AISLAMIENTO Y ESTUDIO GENÓMICO DE RHIZOBIUM sp. DE RIZOSFERA DE CAÑA DE AZÚCAR
Año:2015
Áreas de investigación
  • Microbiología
Datos
Descripción
La caña de azúcar es el principal cultivo energético en Brasil. Produce las mayores cantidades conocidas de biomasa (150 Tm/Ha bajo condiciones óptimas de cultivo). El azúcar extraído de la caña tiene una función mixta, para alimentación y para la producción de etanol usado como combustible. Los altos valores de productividad de este cultivo extensivo en Brasil suponen un elevado requerimiento de macronutrientes (nitrógeno y fosfato) que se deben de tomar del suelo. La disponibilidad de estos nutrientes puede limitar el rendimiento del cultivo y determinar el posible uso de fertilizantes. A diferencia de la mayoría de zonas de cultivo de caña en el mundo, muchas de las plantaciones del estado de São Paulo necesitan mínima fertilización con nitrógeno y fosfato, manteniendo un alto rendimiento año tras año. Nuestra hipótesis de trabajo postula que gran parte del aporte de nitrógeno y fosfato necesarios para la planta deriva de microorganismos asociados a la caña de azúcar. Desde hace casi un siglo se conoce que la nutrición mineral de las plantas está facilitada por microorganismos asociados a la misma, lo que constituye su microbioma, de modo análogo al microbioma de los animales y del hombre, donde modula la nutrición y la respuesta inmune. El estudio exhaustivo de los microbiomas en general sólo ha sido factible gracias al desarrollo de nuevas técnicas de ultrasecuenciación de ADN, como método para detectar e identificar microorganismos sin necesidad de cultivarlos. Estas técnicas permiten no sólo el estudio de la diversidad de organismos, sino la determinación de su potencial metabólico, lo que permite aspirar al desarrollo de nuevas estrategias de agricultura sostenible. Uno de los objetivos de mi tesis doctoral es el estudio del papel de bacterias del género Rhizobium como parte del microbioma de la caña de azúcar mediante el uso de técnicas de ultrasecuenciación. Las razones que justifican este objetivo son dos, i) Rhizobium se encuentra en todos los microbiomas de planta estudiados, y ii) datos preliminares confirman que los microorganismos más abundante en la rizosfera de la caña de azúcar pertenecen al género Rhizobium. El proyecto que proponemos desarrollar durante la estancia solicitada es ?Aislamiento y Estudio Genómico de Rhizobium sp. de Rizosfera de Caña de Azúcar?. Para ello usaremos un protocolo desarrollado durante la parte inicial de mi tesis. El sistema se basa en el uso de un medio semi-selectivo. Usaremos la rizosfera de caña de azúcar como material de partida. Se aislarán una gran cantidad de microorganismos capaces de crecer en dicho medio, y para evitar el estudio repetido de aislamientos clonales, se reducirá el tamaño de la población mediante la técnica RAPD. De aquellas bacterias seleccionadas se aislará el ADN genómico, a continuación se realizará la secuenciación de dichos genomas, y como último paso se hará un análisis bioinformático.
Internacional
Si
Lugar
Campinas, Brasil
Tipo
Fecha inicio
22/02/2015
Fecha fin
27/02/2015
Esta actividad pertenece a memorias de investigación
Participantes
  • Autor: Beatriz Jorrin Rubio (UPM)
Grupos de investigación, Departamentos, Centros e Institutos de I+D+i relacionados
  • Creador: Centro o Instituto I+D+i: Centro de Biotecnología y Genómica de Plantas, CBGP
S2i 2022 Observatorio de investigación @ UPM con la colaboración del Consejo Social UPM
Cofinanciación del MINECO en el marco del Programa INNCIDE 2011 (OTR-2011-0236)
Cofinanciación del MINECO en el marco del Programa INNPACTO (IPT-020000-2010-22)