Memorias de investigación
Ponencias en congresos:
Identificación bioinformática de factores de virulencia en el genoma de Pseudomonas savastanoi pv savastanoi NCPPB3335
Año:2010

Áreas de investigación
  • Biología molecular, celular y genética

Datos
Descripción
Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi (Psv) es la bacteria causante de la tuberculosis del olivo, enfermedad caracterizada por la formación de tumores en ramas, tallos y brotes. El análisis bioinformático de la secuencia del genoma de la cepa de referencia Psv NCPPB 3335, con un tamaño total de 5.856.998 pb y un 5712% de G+C, ha revelado la existencia de 5.232 regiones codificantes, muy conservadas en los genomas de Pseudomonas syringae pv. phaseolicola 1448A y P. syringae pv. tabaci 11528. Sin embargo, Psv NCPPB 3335 contiene doce regiones genómicas variables, mayores de 10kb, que están ausentes en los 7 genomas de cepas pertenecientes al complejo P. syringae secuenciadas hasta la fecha. Entre los factores de virulencia identificados, cabe destacar aquellos que podrían contribuir a la capacidad de esta cepa para sobrevivir en un huésped leñoso, tales como genes relacionados con el transporte y catabolismo de una gran variedad de compuestos aromáticos de origen vegetal, la duplicación de secuencias relacionadas con la biosíntesis de la fitohormona ácido indol-3-acético (genes iaaM e iaaH) y su conjugado con el aminoácido lisina (gen iaaL), así como un amplio repertorio de secuencias relacionadas con efectores del sistema de secreción tipo III (ver comunicación presentada por Antúnez-Lamas et al.). La secuenciación de este genoma, facilita el diseño y abordaje de estrategias de alto rendimiento dirigidas a la disección de los mecanismos que conducen a la formación de tumores en plantas leñosas por una bacteria fitopatógena.
Internacional
No
Nombre congreso
XV Congreso de la Sociedad Española de Fitopatología
Tipo de participación
960
Lugar del congreso
Vitoria
Revisores
Si
ISBN o ISSN
978-84-457-3083-6
DOI
Fecha inicio congreso
27/09/2010
Fecha fin congreso
01/10/2010
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Título de las actas
Identificación bioinformática de factores de virulencia en el genoma de Pseudomonas savastanoi pv savastanoi NCPPB3335

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Participantes

Grupos de investigación, Departamentos, Centros e Institutos de I+D+i relacionados
  • Creador: Grupo de Investigación: Interacciones Moleculares Planta-Patógeno
  • Centro o Instituto I+D+i: Centro de Biotecnología y Genómica de Plantas, CBGP