Observatorio de I+D+i UPM

Memorias de investigación
Communications at congresses:
Identificación bioinformática de factores de virulencia en el genoma de Pseudomonas savastanoi pv savastanoi NCPPB3335
Year:2010
Research Areas
  • Molecular, cellular and genetic biology
Information
Abstract
Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi (Psv) es la bacteria causante de la tuberculosis del olivo, enfermedad caracterizada por la formación de tumores en ramas, tallos y brotes. El análisis bioinformático de la secuencia del genoma de la cepa de referencia Psv NCPPB 3335, con un tamaño total de 5.856.998 pb y un 5712% de G+C, ha revelado la existencia de 5.232 regiones codificantes, muy conservadas en los genomas de Pseudomonas syringae pv. phaseolicola 1448A y P. syringae pv. tabaci 11528. Sin embargo, Psv NCPPB 3335 contiene doce regiones genómicas variables, mayores de 10kb, que están ausentes en los 7 genomas de cepas pertenecientes al complejo P. syringae secuenciadas hasta la fecha. Entre los factores de virulencia identificados, cabe destacar aquellos que podrían contribuir a la capacidad de esta cepa para sobrevivir en un huésped leñoso, tales como genes relacionados con el transporte y catabolismo de una gran variedad de compuestos aromáticos de origen vegetal, la duplicación de secuencias relacionadas con la biosíntesis de la fitohormona ácido indol-3-acético (genes iaaM e iaaH) y su conjugado con el aminoácido lisina (gen iaaL), así como un amplio repertorio de secuencias relacionadas con efectores del sistema de secreción tipo III (ver comunicación presentada por Antúnez-Lamas et al.). La secuenciación de este genoma, facilita el diseño y abordaje de estrategias de alto rendimiento dirigidas a la disección de los mecanismos que conducen a la formación de tumores en plantas leñosas por una bacteria fitopatógena.
International
No
Congress
XV Congreso de la Sociedad Española de Fitopatología
960
Place
Vitoria
Reviewers
Si
ISBN/ISSN
978-84-457-3083-6
Start Date
27/09/2010
End Date
01/10/2010
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Identificación bioinformática de factores de virulencia en el genoma de Pseudomonas savastanoi pv savastanoi NCPPB3335
Participants
  • Autor: Pablo Rodriguez Palenzuela (UPM)
  • Autor: Isabel Matas (Universidad de Málaga)
  • Autor: Emilia Antonia Lopez Solanilla (UPM)
  • Autor: Cayo Ramos (Universidad de Málaga)
  • Autor: Jesús Murillo (Universidad Pública de Navarra)
Research Group, Departaments and Institutes related
  • Creador: Grupo de Investigación: Interacciones Moleculares Planta-Patógeno
  • Centro o Instituto I+D+i: Centro de Biotecnología y Genómica de Plantas, CBGP
S2i 2020 Observatorio de investigación @ UPM con la colaboración del Consejo Social UPM
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