Observatorio de I+D+i UPM

Memorias de investigación
Communications at congresses:
Análisis Bioinformático y Funcional de efectores del sistema de secreción tipo III en Pseudomonas savastanoi pv savastanoi NCPPB 3335
Year:2010
Research Areas
  • Molecular, cellular and genetic biology
Information
Abstract
Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi (Psv) es la bacteria causante de la tuberculosis del olivo. La reciente secuenciación del genoma de la cepa Psv NCPPB 3335 ha permitido el abordaje de estrategias de alto rendimiento para la identificación de genes que codifican efectores putativos del sistema de secreción tipo III (T3SS). En primer lugar, se llevó a cabo una búsqueda de secuencias relacionadas con efectores T3SS en el genoma de Psv utilizando tres aproximaciones bioinformáticas: i) homología de secuencia con efectores previamente descritos, ii) presencia de péptido señal de translocación y, iii) presencia de promotores inducibles por el regulador HrpL (caja hrp). Este análisis reveló la existencia de 30 genes candidatos, de entre los cuales, 19 mostraron una identidad elevada con efectores previamente descritos en otras bacterias fitopatógenas. Otros 11 genes, en los cuales se identificó tanto la caja hrp como la secuencia codificadora del péptido señal, no mostraron identidad con la secuencia de ningún gen con función conocida hasta la fecha. Con el fin de determinar si los genes identificados bioinformáticamente codifican proteínas translocadas a través del T3SS de Psv, se han llevado a cabo fusiones traduccionales de algunos de ellos al codificador de la adenilato ciclasa (cyaA), utilizando para ello la tecnología Gateway. Este ensayo, se basa en la cuantificación del AMPc producido como consecuencia de la actividad catalítica del domino Cya, el cual activa de forma exclusiva e irreversible la calmodulina eucariota. Tras seleccionar transformantes de las fusiones construidas en la cepa silvestre Psv NCPPB 3335 y en un mutante nulo de secreción afectado en el gen hrpA (NCPPB 3335¿hrpA), los ensayos de translocación se están llevado a cabo en plantas de Nicotiana benthamiana var. Newdel, huésped en el cual Psv induce una reacción incompatible
International
No
Congress
XV congreso de la Sociedad Española de Fitopatología
960
Place
Vitoria
Reviewers
Si
ISBN/ISSN
978-84-457-3083-6
Start Date
27/09/2010
End Date
01/10/2010
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Análisis Bioinformático y Funcional de efectores del sistema de secreción tipo III en Pseudomonas savastanoi pv savastanoi NCPPB 3335
Participants
  • Autor: Isabel Matas (Universidad de Málaga)
  • Autor: Pablo Rodriguez Palenzuela (UPM)
  • Autor: M.Pilar Castañeda Ojeda (Universidad de Málaga)
  • Autor: Maria Antunez Lamas (UPM)
  • Autor: Isabel M. Aragón (Universidad de Málaga)
  • Autor: Emilia Antonia Lopez Solanilla (UPM)
  • Autor: Cayo Ramos (Universidad de Málaga)
  • Autor: Jesús Murillo (Universidad Pública de Navarra)
Research Group, Departaments and Institutes related
  • Creador: Grupo de Investigación: Interacciones Moleculares Planta-Patógeno
  • Centro o Instituto I+D+i: Centro de Biotecnología y Genómica de Plantas, CBGP
S2i 2020 Observatorio de investigación @ UPM con la colaboración del Consejo Social UPM
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